This means that the relationships in these nodes are not very strong. Potential reasons for this could include greater variation in the cox1 gene between species or alignment problems. Additionally, since each gene family acts as a semi-independent evolutionary unit, it may not accurately reflect the relationship between species. That is, while the entire genome evolves in one way, some gene families may evolve differently. Therefore, the tree obtained from cox1 may not reflect the rela- tionships of all eukaryotic species very well. As a result, while the relationships of the cox1 gene in eukaryotic organisms among close relatives seem to be reliable, its relationships with distant sequences should be examined more carefully in order to make an evolutionary interpretation.

Bu, bu düğümlerdeki ilişkilerin çok güçlü olmadığı anlamına gelir. Bunun olası nedenleri Cox1 geninde türler arasında daha fazla değişiklik olması veya hizalama sorunları içerir. Ayrıca, Her gen ailesi yarı bağımsız bir evrimsel birim olarak hareket ettiğinden, bu durumu tam olarak yansıtmayabilir. türler arasındaki ilişki. Yani genomun tamamı tek bir yönde gelişirken, bazı genler aileler farklı şekilde gelişebilir. Bu nedenle cox1'den elde edilen ağaç ilişkiyi yansıtmayabilir. tüm ökaryotik türlerin ilişkileri çok iyi. Sonuç olarak cox1 geninin ilişkileri Yakın akrabalar arasındaki ökaryotik organizmalarda güvenilir görünmektedir, uzak organizmalarla olan ilişkileri ise Evrimsel bir yorum yapabilmek için dizilerin daha dikkatli incelenmesi gerekmektedir.